Ekskul OSN SMPN 3 X Koto adalah program pembinaan bagi siswa berbakat di berbagai bidang sains, matematika, dan ilmu sosial untuk dipersiapkan menghadapi Olimpiade Sains Nasional (OSN). Dalam ekskul ini, siswa mendapat pelatihan intensif berupa pemahaman materi lanjutan, latihan soal, serta pembimbingan khusus dari guru berpengalaman. Ekskul ini bertujuan untuk mencetak siswa berprestasi yang siap berkompetisi di tingkat kabupaten, provinsi, hingga nasional, serta mengembangkan keterampilan berpikir kritis dan problem-solving.